Der ZMD fördert die islamische Religion und verantwortet die allseitige Religionspflege seiner Mitgliedsorganisationen und den in ihnen organisierten natürlichen Personen.
Von besonderer Bedeutung für die allseitige Religionspflege ist die Förderung der Errichtung und Unterhaltung von Moscheen und Gebetsräumen als Zentren des religiösen Lebens der Muslime.
Der ZMD setzt sich für einen Religionsunterricht im Sinne des Artikels 7 Absatz 3 des Grundgesetzes nach dem Bekenntnis und Selbstverständnis des Islams an öffentlichen Schulen ein.
Der ZMD setzt sich für die Einrichtung und den Ausbau islamischer Lehrstühle an staatlichen und privaten Hochschulen und Akademien sowie für die Ausbildung und Weiterbildung insbesondere von islamischen Gelehrten, Imamen, Islamwissenschaftlern und Lehrern durch die islamischen Religionsgemeinschaften in Deutschland ein.